创新层挂牌公司出现因更正年报数据导致财务指标不符合创新层标准的，应当在第二年层级调整时直接调整进入基础层。

Ⅰ、Ⅱ两项正确，《全国中小企业股份转让系统挂牌公司分层管理办法》第10条规定，全国股转公司根据分层标准及维持标准，于每年4月30日启动挂牌公司所属层级的调整工作。基础层的挂牌公司，符合创新层条件的，调整进入创新层；不符合创新层维持条件的挂牌公司，调整进入基础层。全国股转公司可以根据分层管理的需要，适当提高或降低挂牌公司层级调整的频率。
　　Ⅲ项正确，第11条第1款规定，全国股转公司正式调整挂牌公司层级前，在全国股转系统官网公示进入基础层和创新层的挂牌公司名单。挂牌公司对分层结果有异议或者自愿放弃进入创新层的，应当在3个转让日内提出。全国股转公司可视异议核实情况调整分层结果。
　　Ⅳ项正确，是属于第7条第2项禁止情形，挂牌公司或其控股股东、实际控制人，现任董事、监事和高级管理人员因信息披露违规、公司治理违规、交易违规等行为被中国证监会及其派出机构采取行政监管措施或者被采取行政处罚，或者正在接受立案调查，尚未有明确结论意见，不得调整进入创新层；
　　Ⅴ项错误，第12条第3项规定，挂牌公司不符合创新层公司治理要求且“持续时间”达到3个月以上的，自该情形认定之日起20个转让日内直接调整至基础层。
　　故Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ项正确，选C。