我国社会保障水平目前存在的最大问题是结构不合理。

1、医疗服务收费标准总体来说仍低于成本：成本高于收费标准的项目十分普遍；根据卫生决算分析全国医疗机构亏损过高；体现技术项目如挂号、诊疗、护理等技术服务价格过低，低于成本；政府补助仅占综合性医院总收入较小部分。
2、卫生行业收费比价、差价不合理。
3、技术劳务的价值在卫生价格上没有得到充分体现：劳务费仅占全部医疗费用的极小部分，比例极不平衡。
4、卫生服务价格的制订缺乏科学的方法和依据：成本核算是制定科学、合理的卫生服务价格的重要依据。
5、价格管理体制过于僵化，我国医疗服务价格实行高度集中的计划管理体制，医疗收费标准统得过死，价格管理权限仍过于集中，下级政府缺乏宏观调控能力。
6、卫生服务实行低价格政策：医院从市场上购进的各种医用材料、医疗设备以及基建维修等都必须按市场价格结算，医疗成本费用明显上升。医疗收费标准却公然实行不含工资和折旧的低成本的价格政策，因而导致卫生机构政策性亏损大，财政负担沉重。